Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms