Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms