Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms