Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL6Q9BWW8 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms