Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS8Q99627 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS8Q99627 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS8Q99627 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS8Q99627 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS8Q99627 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS8Q99627 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS8Q99627 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS8Q99627 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS8Q99627 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS8Q99627 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS8Q99627 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS8Q99627 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS8Q99627 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS8Q99627 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS8Q99627 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS8Q99627 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms