Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPZA3Q96KX2 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms