Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 PTPRS-201ENST00000262963 4766 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 PCDH20-201ENST00000409204 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 PTPRS-210ENST00000592099 4766 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 GOLGA6L4-203ENST00000510439 4563 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 YLPM1-201ENST00000325680 7108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 STK24-208ENST00000539966 9361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 VCPIP1-201ENST00000310421 9942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 VCL-202ENST00000372755 6489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 BAIAP2-AS1-202ENST00000577066 4465 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 STAG1-203ENST00000434713 5064 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 PKD1L2-210ENST00000533478 5669 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 MTHFR-204ENST00000376590 7094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 NFASC-202ENST00000360049 10120 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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