Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 LINC01922-201ENST00000562582 719 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms