Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTD1Q8N815 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTD1Q8N815 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTD1Q8N815 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTD1Q8N815 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTD1Q8N815 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTD1Q8N815 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTD1Q8N815 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTD1Q8N815 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTD1Q8N815 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTD1Q8N815 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTD1Q8N815 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTD1Q8N815 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNTD1Q8N815 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNTD1Q8N815 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNTD1Q8N815 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNTD1Q8N815 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNTD1Q8N815 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNTD1Q8N815 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNTD1Q8N815 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNTD1Q8N815 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD1Q8N815 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms