Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CATSPER4Q7RTX7 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms