Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4L3Q6VB84 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms