Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms