Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 IP6K2-221ENST00000449610 1673 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 CSNK1G1-207ENST00000634654 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms