Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms