Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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