Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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CYTH1Q15438 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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