Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL19A1Q14993 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL19A1Q14993 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL19A1Q14993 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COL19A1Q14993 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL19A1Q14993 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL19A1Q14993 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL19A1Q14993 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL19A1Q14993 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL19A1Q14993 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COL19A1Q14993 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL19A1Q14993 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL19A1Q14993 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
COL19A1Q14993 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL19A1Q14993 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL19A1Q14993 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL19A1Q14993 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL19A1Q14993 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COL19A1Q14993 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
COL19A1Q14993 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COL19A1Q14993 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COL19A1Q14993 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
COL19A1Q14993 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL19A1Q14993 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL19A1Q14993 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL19A1Q14993 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COL19A1Q14993 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COL19A1Q14993 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COL19A1Q14993 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL19A1Q14993 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL19A1Q14993 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL19A1Q14993 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL19A1Q14993 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL19A1Q14993 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL19A1Q14993 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL19A1Q14993 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL19A1Q14993 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL19A1Q14993 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL19A1Q14993 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL19A1Q14993 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL19A1Q14993 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL19A1Q14993 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL19A1Q14993 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL19A1Q14993 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL19A1Q14993 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL19A1Q14993 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL19A1Q14993 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL19A1Q14993 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL19A1Q14993 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL19A1Q14993 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL19A1Q14993 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL19A1Q14993 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL19A1Q14993 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL19A1Q14993 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL19A1Q14993 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
COL19A1Q14993 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL19A1Q14993 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL19A1Q14993 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
COL19A1Q14993 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
COL19A1Q14993 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL19A1Q14993 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL19A1Q14993 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL19A1Q14993 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL19A1Q14993 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
COL19A1Q14993 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL19A1Q14993 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL19A1Q14993 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL19A1Q14993 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL19A1Q14993 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL19A1Q14993 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL19A1Q14993 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL19A1Q14993 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms