Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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