Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTCH1Q13635 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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PTCH1Q13635 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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PTCH1Q13635 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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PTCH1Q13635 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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PTCH1Q13635 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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PTCH1Q13635 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
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PTCH1Q13635 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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