Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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DUSP4Q13115 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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