Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms