Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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