Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms