Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms