Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms