Protein–RNA interactions for Protein: Q00722

PLCB2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB2Q00722 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 AC006064.1-201ENST00000499202 560 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 CCDC32-214ENST00000561011 1577 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms