Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ERVPABLB-1P60509 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ERVPABLB-1P60509 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ERVPABLB-1P60509 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ERVPABLB-1P60509 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ERVPABLB-1P60509 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ERVPABLB-1P60509 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ERVPABLB-1P60509 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ERVPABLB-1P60509 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ERVPABLB-1P60509 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ERVPABLB-1P60509 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms