Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ME1P48163 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ME1P48163 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ME1P48163 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ME1P48163 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ME1P48163 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ME1P48163 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ME1P48163 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ME1P48163 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ME1P48163 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ME1P48163 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ME1P48163 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ME1P48163 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ME1P48163 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ME1P48163 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ME1P48163 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ME1P48163 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ME1P48163 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ME1P48163 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ME1P48163 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ME1P48163 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ME1P48163 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ME1P48163 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ME1P48163 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ME1P48163 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ME1P48163 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ME1P48163 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ME1P48163 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ME1P48163 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ME1P48163 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ME1P48163 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ME1P48163 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ME1P48163 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ME1P48163 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ME1P48163 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ME1P48163 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ME1P48163 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ME1P48163 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ME1P48163 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ME1P48163 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ME1P48163 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ME1P48163 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ME1P48163 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ME1P48163 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ME1P48163 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ME1P48163 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ME1P48163 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ME1P48163 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ME1P48163 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ME1P48163 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ME1P48163 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ME1P48163 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ME1P48163 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ME1P48163 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ME1P48163 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms