Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms