Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms