Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ARL3P36405 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ARL3P36405 AC080128.2-201ENST00000641520 11863 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ARL3P36405 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ARL3P36405 GPR161-208ENST00000537209 8256 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ARL3P36405 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ARL3P36405 NWD1-206ENST00000552788 6964 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ARL3P36405 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 HSPA12A-201ENST00000369209 5722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 VPS13A-205ENST00000376636 11145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 LCMT2-201ENST00000305641 6957 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 CACNA1C-205ENST00000399591 6535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 CACNA1C-206ENST00000399595 6535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 CACNA1C-207ENST00000399597 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 CACNA1C-208ENST00000399601 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 CACNA1C-217ENST00000399641 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 CACNA1C-218ENST00000399644 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL3P36405 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ARL3P36405 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
ARL3P36405 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
ARL3P36405 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ARL3P36405 FAM225B-201ENST00000423546 5629 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ARL3P36405 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ARL3P36405 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ARL3P36405 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ARL3P36405 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms