Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms