Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
EGR1P18146 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
EGR1P18146 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
EGR1P18146 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
EGR1P18146 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
EGR1P18146 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
EGR1P18146 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
EGR1P18146 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
EGR1P18146 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
EGR1P18146 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
EGR1P18146 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
EGR1P18146 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
EGR1P18146 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
EGR1P18146 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
EGR1P18146 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
EGR1P18146 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
EGR1P18146 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
EGR1P18146 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
EGR1P18146 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
EGR1P18146 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
EGR1P18146 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
EGR1P18146 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EGR1P18146 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
EGR1P18146 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
EGR1P18146 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
EGR1P18146 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
EGR1P18146 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
EGR1P18146 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
EGR1P18146 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
EGR1P18146 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
EGR1P18146 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
EGR1P18146 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
EGR1P18146 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
EGR1P18146 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
EGR1P18146 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
EGR1P18146 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
EGR1P18146 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
EGR1P18146 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
EGR1P18146 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
EGR1P18146 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
EGR1P18146 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
EGR1P18146 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
EGR1P18146 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms