Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms