Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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TCAF1Q9Y4C2 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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TCAF1Q9Y4C2 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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TCAF1Q9Y4C2 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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TCAF1Q9Y4C2 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TCAF1Q9Y4C2 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TCAF1Q9Y4C2 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TCAF1Q9Y4C2 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TCAF1Q9Y4C2 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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TCAF1Q9Y4C2 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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