Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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