Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSPNQ9HAW4 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLSPNQ9HAW4 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLSPNQ9HAW4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLSPNQ9HAW4 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLSPNQ9HAW4 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLSPNQ9HAW4 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLSPNQ9HAW4 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSPNQ9HAW4 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSPNQ9HAW4 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSPNQ9HAW4 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSPNQ9HAW4 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSPNQ9HAW4 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSPNQ9HAW4 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms