Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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