Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHAMP1Q96JM3 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms