Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY4

TTC28, Tetratricopeptide repeat protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 2,481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28Q96AY4 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 WNT8A-202ENST00000398754 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 CD8B-202ENST00000349455 849 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 SMARCB1-203ENST00000407082 1182 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 TIMM23-201ENST00000580018 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 AC006504.5-210ENST00000585827 539 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 SFTPA2-202ENST00000372327 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 AC138035.2-201ENST00000509192 727 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 AACSP1-202ENST00000521412 1095 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 RPL10P8-201ENST00000522888 313 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 RPL30-213ENST00000523172 274 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 LINC02193-207ENST00000621799 723 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 AC069287.1-202ENST00000622626 723 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 TRIQK-219ENST00000523580 1630 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 THEG-204ENST00000530711 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 ZNF268-208ENST00000539248 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 ZNF268-212ENST00000542711 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 AC026150.1-201ENST00000562992 701 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 MIR4309-201ENST00000582498 83 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 GZMH-201ENST00000216338 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 AC069257.3-201ENST00000431391 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TTC28Q96AY4 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms