Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
USP13Q92995 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP13Q92995 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP13Q92995 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USP13Q92995 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms