Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBRM1Q86U86 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms