Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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ZNF549Q6P9A3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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ZNF549Q6P9A3 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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ZNF549Q6P9A3 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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ZNF549Q6P9A3 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ZNF549Q6P9A3 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ZNF549Q6P9A3 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ZNF549Q6P9A3 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ZNF549Q6P9A3 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ZNF549Q6P9A3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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