Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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RTL6Q6ICC9 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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RTL6Q6ICC9 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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RTL6Q6ICC9 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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RTL6Q6ICC9 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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RTL6Q6ICC9 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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RTL6Q6ICC9 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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RTL6Q6ICC9 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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RTL6Q6ICC9 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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RTL6Q6ICC9 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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RTL6Q6ICC9 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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RTL6Q6ICC9 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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