Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms