Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGAP9Q5VTM2 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms