Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms