Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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NCOA1Q15788 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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NCOA1Q15788 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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NCOA1Q15788 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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NCOA1Q15788 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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NCOA1Q15788 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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NCOA1Q15788 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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NCOA1Q15788 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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NCOA1Q15788 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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NCOA1Q15788 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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NCOA1Q15788 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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NCOA1Q15788 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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