Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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