Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
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CDSNQ15517 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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CDSNQ15517 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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CDSNQ15517 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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